В список субсидируемых из федерального бюджета направлений ГУП «Аэропорт Оренбург» вошли рейсы по маршрутам: Самара-Казань и Самара-Оренбург, выполняемые ежедневно; Казань-Оренбург, Самара-Киров, Уфа-Ижевск, Уфа-Оренбург, Уфа-Пермь, выполняемые 3 раза в неделю. Информацию об увеличении перечня субсидируемых маршрутов 15 февраля опубликовало на своём сайте федеральное Агентство воздушного транспорта.
Программа субсидирования региональных воздушных перевозок на территории Российской Федерации и формирования региональной маршрутной сети Российской Федерации реализуется в соответствии с постановлением Правительства Российской Федерации от 25.12.2013 № 1242.
Включение в список субсидируемых из федерального бюджета рейсов, выполняемых авиакомпанией «Оренбуржье», стало возможным благодаря личному обращению губернатора Оренбургской области Юрия Берга к министру транспорта Российской Федерации Максиму Соколову. Глава области предложил включить маршруты, выполняемые авиакомпанией «Оренбуржье» в Приволжском федеральном округе, в перечень субсидируемых в 2017 году. С аналогичным предложением в министерство транспорта было направлено письмо от профсоюза лётного состава России и ГУП Оренбургской области «Аэропорт Оренбург», в котором подчеркивалась социальная значимость указанных маршрутов.